A Gerência de Planejamento e Acompanhamento de Gestão (GEPLAG) auxilia e assessora o Superintendente do HCFMB na formulação e controle de execução do plano de ação da instituição. Também coordena o planejamento estratégico para aplicação nos departamentos e unidades hospitalares associadas ao Complexo do HCFMB.

Além disso, estabelece critérios básicos para a melhoria contínua da gestão das atividades do Hospital, formula novas políticas administrativas, coordena a elaboração de planos, programas e projetos, bem como sua execução.

As atribuições da GEPLAG são:
I – assessorar o Superintendente na formulação e no controle da execução do plano de ação do HCFMB;
II – realizar estudos para a formulação da política e das diretrizes a serem adotadas;
III – participar da elaboração dos planos, programas e projetos, bem como, acompanhar a sua execução;
IV – prestar orientação técnica aos órgãos do HCFMB;
V – elaborar relatórios sobre a execução do plano de ação do HCFMB;
VI – propor as prioridades na alocação de recursos para a elaboração da proposta orçamentária;
VII – orientar sobre os planos, programas e projetos;
VIII – analisar propostas de criação ou modificação de estruturas administrativas;
IX – propor a correção, o aperfeiçoamento, a uniformização e a regularização de atividades administrativas, técnicas, financeiras e orçamentárias, visando o cumprimento das normas legais;
X – acompanhar o andamento da gestão da Autarquia;
XI – elaborar, gerir e acompanhar a execução dos convênios firmados com instituições públicas ou privadas;
XII – cumprir as diretrizes dos princípios da administração pública;
XIII – elaborar e atualizar o manual de gestão de convênios e contratos da instituição;
XIV – gerenciar a apuração de custos hospitalares;
XV – desenvolver ações na instituição para uniformizar apuração de custos hospitalares.